Genotypisierung von Pflanzen mittels molekularer Marker
Von Kader Fatmi und Stéphanie Guillet, Eurofins Scientific Analytics, Frankreich
Eurofins Food Testing Newsletter Nr. 20 - März 2006
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Saatgutproduzenten, Wissenschaftler und Forschungsinstitute nutzen molekulare Marker für verschiedene Anwendungen, wie z. B. Monitoring von Markergenen, genetische Artenidentifizierung oder Qualitätskontrolle von Saatgut.
Viele molekulare Marker können entsprechend ihrer Charakterzüge, der Art des zu analysierenden Materials, sowie der potentiellen Anwendungen genutzt und gegebenenfalls kombiniert werden. Zu diesen Markern zählen hauptsächlich:
- Mikrosatelliten Marker oder SSR (Short Sequence Repeat oder auch Single Sequence Repeat), welche in nicht kodierten Regionen mit einem wiederkehrenden Motiv wie z. B. (CA)n auftreten. Dieses sind hoch polymorphe Marker, die für jede Spezies entwickelt werden müssen;
- AFLP (Amplifi ed Fragment Length Polymorphism) Marker, welche man durch enzymatischen Verdau von DNA und selektive Amplifikation der entsprechenden Regionen erhält. Dieses sind polymorphe Marker, die leicht für jede Spezies generiert werden können, ohne Kenntnis der spezifischen Sequenz.
Eurofins gehört zu den führenden Laboren für Genotypisierung, welche die Analyse dieser molekularen Marker für verschiedene Anwendungen, inklusive der Einrichtung genetischer Fingerabdrücke für Gemüse und Saatgut (Charakterisierung von Sorten, Einrichtung einer Datenbank), der Hybridisierungskontrolle (Auswahl von divergenten Parental-Linien) oder Auswahl mit Hilfe eines Markers anbietet. In dem Eurofins Labor in Nantes werden Genotypisierungsanwendungen auf der Basis von SSR Markern, mit Hilfe von multikapillarer Elektrophorese, einer sehr empfindlichen und verlässlichen Technologie, entwickelt. Andere molekulare Marker, wie AFLP und RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism) Marker oder SNP Technologie (Single Nucleotide Polymorphismus) für Routineanwendungen oder für kundenspezifische Projekte, sind verfügbar.
Kontakt: kaderfatmi@eurofins.com