AFLP: DNA-basierte Qualitätskontrolle von Produktionsstämmen in der industriellen Bierproduktion
Von Andreas Pardigol, Eurofins Scientific Analytics, Frankreich
Eurofins Food Testing Newsletter Nr. 28 - November 2008
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Die Qualität eines Bieres, insbesondere hinsichtlich Geschmack und Schaumbildung, ergibt sich aus den charakteristischen Eigenschaften seiner Inhaltsstoffe.
Die Qualität eines Bieres hängt von der Qualität der Hauptzutaten für die Bierproduktion wie Hefe, Hopfen und Gerste ab. Spezifische Produkteigenschaften können aus verschiedenen Gründen variieren, bei-I spielsweise aufgrund von Kontaminationen der verwendeten Hefestämme oder anderer Zutaten oder aufgrund von genetischer Variation. Die regelmäßige Überprüfung der Identität und Reinheit der Produktionsstämme ist daher von entscheidender Bedeutung.
Das DNA-Fingerprinting („Genotypisierung") kann für die eindeutige Identifizierung der Stämme eingesetzt werden. Eurofins Scientific Analytics hat sich auf die Erstellung von DNA-Profilen spezialisiert, auf sog. genetische Fingerabdrücke, und zwar von Tieren und Pflanzen - mit besonderem Schwerpunkt auf Getreide, Gemüse, Obst und Bäume sowie Tiere, z.B. Rinder.
Bei diesen Analysen kommen verschiedene DNA-Fingerprinting-Methoden zum Einsatz, beispielsweise AFLP (Amplifikations-Fragment-Längen-Polymorphismus). Die AFLP-Methode ermöglicht die Amplifikation von bis zu 100 DNA-Markern mit sehr hoher Auflösung über das gesamte Genom in einem Reaktionsansatz. DNA-Sequenzdaten müssen nicht bekannt sein, um einen neuen Assay zu etablieren, so dass kundenspezifische Lösungen sehr schnell entwickelt werden können.
Als erster Schritt bei der Entwicklung eines maßgeschneiderten AFLP-Tests ist die Charakterisierung des vom Kunden verwendeten Stamms erforderlich (DNA-Extraktion und Bestimmung eines stammspezifischen AFLP-Fingerprints). Nach der initialen Validierung kann diese Analyse dann routinemäßig durchgeführt werden.
Zusätzlich zu den in Brauereien verwendeten Produktionsstämmen kann die AFLP-Methode auch für andere Bereiche der Lebensmittelproduktion eingesetzt werden, u.a. für die Erstellung von DNA-Profilen biotechnologisch hergestellter Stämme oder auch die genaue Bestimmung von Obst-und Gemüsesorten.
Kontakt: AndreasPardigol@eurofins.com